Komisja Warrena (oficjalna nazwa angielska: The President's Commission on the Assassination of President Kennedy, dosłownie: Prezydencka komisja w sprawie zabójstwa prezydenta Kennedy'ego) - specjalna komisja śledcza powołana 29 listopada 1963 przez prezydenta Stanów Zjednoczonych Lyndona Johnsona w celu zbadania sprawy zabójstwa prezydenta Johna F. Kennedy'ego.
Nieoficjalna nazwa komisji - komisja Warrena - pochodzi od nazwiska jej przewodniczącego Earla Warrena, prezesa Sądu Najwyższego Stanów Zjednoczonych.
W skład komisji wchodzili:
Komisja ustaliła, że Lee Harvey Oswald był jedynym zabójcą odpowiedzialnym za śmierć prezydenta Kennedy'ego.
Ustalenia komisji budziły bardzo silne kontrowersje i były często podważane.
Wynikiem prac komisji był opublikowany przez nią raport.