Włodzimierz Zajączkowski (ur. 21 czerwca 1914 w Wilnie, zm. 3 września 1982 w Krakowie) – polski turkolog narodowości karaimskiej, absolwent i wieloletni profesor Uniwersytetu Jagiellońskiego.
Pochowany jest na cmentarzu karaimskim przy ulicy Redutowej w Warszawie.
Prace Włodzimierza Zajączkowskiego dotyczyły dialektów ludów tureckich i ich folkloru: